Relation protéine / ADN


Au sein d'une même espèce, les individus présentent des phénotypes différents, liés à des variations des protéines. Ces variations ont une origine génétique.

Comment la séquence des acides aminés d'une protéine est-elle déterminée génétiquement ?

 

En travaux pratiques : étude des causes moléculaire de la drépanocytose

Il est possible d'établir cette relation à l'aide du logiciel Anagène : auparavant, il est souhaitable de bien définir la structure de la molécule d'hémoglobine normale et d'hémoglobine S.

1) Comparaison entre les structures des deux protéines :

Cette comparaison peut être effectuée à partir des documents enregistrés dans Anagène, mais aussi à partir de script CHIME sur le net.

 

Cette copie d'écran montre bien la différence de structure entre les deux molécules.

 

2) Comment expliquer les troubles pathologiques :

Utiliser les documents du logiciel Anagène pour compléter l'explication déjà abordée par l'étude ci-dessus.

Pour cela :
- Lancer ANAGENE, charger le thème d'étude "expression de l'information génétique" puis "relation génotype phénotype" puis "phénotype drépanocytaire". L'écran suivant doit apparaître :

- Cliquez sur l'icone document,

la fenêtre suivante apparaît :

Elle permet l'accès aux documents.

 

3) Étude des séquences de bases azotées et d'acides aminés :

En comparant la longueur en acides aminés d'une part et en bases azotées d'autre part, il est possible d'aboutir à la notion de triplet et de faire la relation entre un triplet et un acide aminé.

La recherche des différences entre les deux chaînes amène à la notion de codage entre gène et protéine. Un premier triplet peut ici être décodé.

D'autres exemples du logiciel peuvent être utilisés pour établir cette comparaison.

 

Pour télécharger et installer les logiciels de visualisation en 3D des molécules. http://www.inrp.fr/Acces/Biogeo/
model3d/visu3d.htm
Comparaison entre la molécule d'hémoglobine normale et de la drépanocytose. http://www2.ac-lyon.fr/enseigne/biologie/
ress/logiciel/ana_ras/drep.html
Le site du Généthon sur la structure de la molécule. http://www.genethon.fr/
www_bio_servers.html
Gènes et maladies chez l'homme : le site du NCBI. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/disease/
Cours de biologie cellulaire en anglais. http://esg-www.mit.edu:8001/esgbio/
chapters.html
Étude de l'efficacité d'une enzyme. Le lysozyme en fonction de la position de la mutation par rapport au site actif.

http://www.ac-bordeaux.fr/
Pedagogie/SVT/svt.htm

D e la page d'accueil SVT, cliquez activités pédagogiques puis sur travaux pratiques puis enfin lysozyme.

Les effets d'une mutation sur la catalyse enzymatique. http://www.inrp.fr/Acces/Biogeo/model3d/
chimdata/scripts/cpa/cpacata.htm
Différents scripts pour RASMOL. http://www.umass.edu/microbio/rasmol/
scrip_mz.htm
Relation, mutation, code génétique. http://www.people.virginia.edu/
~rjh9u/hbshist.html

 

 

 

 

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